Non sono né animali e né insetti... sono semplicemente Mushi! Si dice che esistano da prima dell'inizio della vita e che la loro esistenza influenzi quelle degli altri esseri viventi. Il protagonista di quest'opera è Ginko, un Mushishi. I Mushishi sono dei collezionisti, studiosi ed esperti di Mushi. L'anime ruota attorno a Ginko ed ai suoi viaggi, viaggi che ci permetteranno di conoscere le storie sui Mushi e sulle persone con cui sono venuti a contatto... compreso lo stesso Ginko.